界面图神经网络预测球状与无序蛋白复合物的结合能
- FlexENN是基于局部界面图的消息传递图神经网络,每个残基节点整合几何、柔性描述符和序列信息。
- 分别独立训练折叠复合物模型和含无序伴侣的复合物模型,并新构建了IDP数据集。
- 基准测试涵盖微管中的微管蛋白-微管蛋白界面以及微管与MAP的复合物。
💡 要点
基于折叠复合物训练的亲和力预测器遇到无序伴侣往往失灵,所以专门的IDP数据集才是真正的贡献。对药化而言这是蛋白-蛋白界面而非小分子打分,我想测试它能否可靠地对突变体或肽变体排序。
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基于折叠复合物训练的亲和力预测器遇到无序伴侣往往失灵,所以专门的IDP数据集才是真正的贡献。对药化而言这是蛋白-蛋白界面而非小分子打分,我想测试它能否可靠地对突变体或肽变体排序。